「尼希米」所發現的一連串弊病，包括百姓虧欠十一奉獻，祭司利未人擅離職守，不守安息日，以及與外族聯姻。種種問題與《瑪拉基書》所呈現的問題完全一致：

瑪拉基書	尼希米記
一6- 二9 祭司虧欠職分	十三1-9 祭司虧欠職分
二10-16 領袖百姓娶外邦妻	十三23-28 領袖百姓娶外邦妻
三7-12 百姓輕忽十一	十三10-13 百姓輕忽十一

所以學者多將這兩卷書放在同一個時代。藉這兩卷書，我們可以一窺舊約結束前，以色列人的信仰生活，已進入一個虛化的過程。 「尼希米」這次返回耶路撒冷，就是要處理這些問題。 一、重新召聚祭司利未人 首先，針對祭司利未人擅離職守的問題。因著「利未人所當得的分無人供給他們」，百姓輕忽十一奉獻的結果，就是殿中所需無法供應，所以「供職的利未人與歌唱的俱各奔回自己的田地去了」。這同時導致殿中荒涼，無人事奉。「尼希米」首先作的，就是重新「招聚利未人，使他們照舊供職」。 二、重新恢復十一奉獻 其次，「尼希米」要求百姓恢復十一與日常的奉獻。百姓也願意獻上「猶大眾人就把五穀、新酒，和油的十分之一送入庫房」。 「尼希米」也設立「忠信」之人「作庫官」管理這些奉獻「祭司示利米雅、文士撒督、利未人毘大雅」。這些「庫官」就將「所供給的分給他們的弟兄」。 因著百姓忠心的十一奉獻，祭司利未人才能無虞的在殿中事奉，使殿不致荒涼，有人獻祭，有人禱告，有人敬拜。 三、求主記念 「尼希米」在處理這些問題時，一定也不容易，因此他禱告說「我的神啊，求你因這事記念我」。他也求上帝「不要塗抹我為神的殿與其中的禮節所行的善」，他不是邀功，乃是希望他所作的，能蒙上帝的悅納。 當「尼希米」站在這個位分上時，他清楚知道自己的使命是甚麼，他從不逃避責任。他主動請纓，勇於承擔，堵住時代的破口，要在一個傾頹的時代中，力挽狂瀾。他所要恢復的不是儀文，乃是真實對上帝的敬拜事奉。